对企业自主创新的评价，其实质是对企业自主创新能力的评价。企业自主创新能力是企业在市场竞争中，通过有效运用企业内外部的各种创新资源，建立新的技术平台或者改变核心技术，并取得自主知识产权，使企业核心竞争力不断增强，从而获得持续竞争优势，在技术创新过程中所表现出来的各种能力的有机综合。因此，企业自主创新能力是由多个能力组成的，涉及企业经营活动的多个方面和活动过程的多个环节。在自主创新过程中，各环节之间及创新与市场需求和技术进步之间还存在着一定的交互关系。

　　从2008年开始，中国企业评价协会首次在全国范围内开展全国性年度企业自主创新评价研究工作，其目的是考核和测算我国企业自主创新能力，总结企业自主创新的经验与成果，挖掘和提炼企业自主创新的规律与特点，反映我国企业在自主创新方面存在的问题，为政府制定相应的自主创新政策提供切实可行的依据，促进我国企业自主创新的深入开展。

　　在总结首次评价工作的基础上，2009年企业自主创新评价重点关注创新产品、创新人物和商业模式三大主题，涵盖工业、服务业和现代农业三大产业，评价从创新投入和创新产出的角度对企业自主创新能力进行考核和测算，评价的结果最终以创新指数推出，从而形成“2009’中国企业自主创新TOP100•工业、TOP100•服务业、TOP100•现代农业”评价结果，同时产生中国企业研发创造奖（15名）、最具投资价值自主创新产品（15名）、最佳商业模式创新奖（15名）和中国企业自主创新十大人物（10名）。目前，评价正在进行当中。